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內(nèi)氏放線(xiàn)菌PCR檢測(cè)試劑盒使用方法

點(diǎn)擊次數(shù):1057 更新時(shí)間:2020-03-19

內(nèi)氏放線(xiàn)菌PCR檢測(cè)試劑盒使用方法 :   

1 實(shí)驗(yàn)所需器材與試劑

1.1 器材

1)PCR儀

2)PCR反應(yīng)管

3)電泳儀及水平電泳槽

4)高速離心機(jī)

5)微量移液器及移液器吸頭

1.2 試劑

1)瓊脂糖

2)EB(溴化乙錠)

3)去離子水或雙蒸水

 

反應(yīng)五要素:

參加PCR反應(yīng)的物質(zhì)主要有五種即引物、酶、dNTP、模板和Mg2+

引物:引物是PCR特異性反應(yīng)的關(guān)鍵,PCR 產(chǎn)物的特異性取決于引物與模板DNA互補(bǔ)的程度。理論上,只要知道任何一段模板DNA序列, 就能按其設(shè)計(jì)互補(bǔ)的寡核苷酸鏈做引物,利用PCR就可將模板DNA在體外大量擴(kuò)增。設(shè)計(jì)引物應(yīng)遵循以下原則:

①引物長(zhǎng)度: 15-30bp,常用為20bp左右。

②引物擴(kuò)增跨度: 以200-500bp為宜,特定條件下可擴(kuò)增長(zhǎng)至10kb的片段。

③引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴(kuò)增效果不佳,G+C過(guò)多易出現(xiàn)非特異條帶。ATGC*隨機(jī)分布,避免5個(gè)以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。

④避免引物內(nèi)部出現(xiàn)二級(jí)結(jié)構(gòu),避免兩條引物間互補(bǔ),特別是3'端的互補(bǔ),否則會(huì)形成引物二聚體,產(chǎn)生非特異的擴(kuò)增條帶。

⑤引物3'端的堿基,特別是末及倒數(shù)第二個(gè)堿基,應(yīng)嚴(yán)格要求配對(duì),以避免因末端堿基不配對(duì)而導(dǎo)致PCR失敗。

⑥引物中有或能加上合適的酶切位點(diǎn), 被擴(kuò)增的靶序列*有適宜的酶切位點(diǎn), 這對(duì)酶切分析或分子克隆很有好處。

⑦引物的特異性:引物應(yīng)與核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)的其它序列無(wú)明顯同源性。

引物量:每條引物的濃度0.1~1umol或10~100pmol,以*引物量產(chǎn)生所需要的結(jié)果為好,引物濃度偏高會(huì)引起錯(cuò)配和非特異性擴(kuò)增,且可增加引物之間形成二聚體的機(jī)會(huì)。

注意事項(xiàng):   

5.1使用本試劑前請(qǐng)仔細(xì)閱讀本說(shuō)明書(shū)全文。

5.2 操作時(shí)應(yīng)盡量少說(shuō)話(huà),因口腔中也含有支原體,可能引起樣品污染,而造成假陽(yáng)性;整個(gè)檢測(cè)過(guò)程中,反應(yīng)體系的配制、樣本處理及加樣、PCR擴(kuò)增應(yīng)分區(qū)域進(jìn)行,以避免交叉污染。 5.3 實(shí)驗(yàn)時(shí),試劑盒組分中的試劑使用前應(yīng)充分融化并混勻(混勻時(shí)禁止激烈振蕩,只需要進(jìn)行上下倒置多次進(jìn)行混勻)。

5.4 反應(yīng)管中加好所有的試劑后,應(yīng)盡快上PCR儀進(jìn)行擴(kuò)增,以免形成過(guò)多的二聚體。

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